Молекулярная динамика



© Шайтан К.В., Сарайкин С.С., 1999

Молекулярная динамика

Расчёт ньютоновских траекторий движения

Методы ускорения расчётов молекулярной динамики

Учёт влияния среды в молекулярной динамике

Периодические граничные условия

Термостаты

Метод комплементарности (docking)

Метод Монте-Карло

Метод Монте-Карло с критерием Метрополиса

Модель роста цепи

Модификации метода Монте-Карло с критерием Метрополиса

Молекулярная динамика с Window Moves

Монте-Карло в пространстве последовательностей аминокислот

Метод минимизации потенциальной энергии

Метод нормальных мод

Упрощённые методы моделирования полипептидов